当院眼科は、日本眼科学会専門医制度研修施設で、眼科専門医3名が常勤している。眼科クリニックの部門に入院設備があり、全身状態が不良の方は、本院の他科との連携を行っている。外来は、1日平均120名、年間38,847名、入院患者は、1日平均10名、平均在院日数が2.6日と短期入院を心がけている。
手術は、白内障、網膜硝子体手術、緑内障、斜視、眼窩、涙道手術（涙道内視鏡も完備）など、すべての疾患に対し対応可能である。平成22年度は1810件（レーザー治療を除く）。手術は、毎日行っており、患者さんのご希望にあわせ、また、緊急時でもすぐに対応できるよう、患者さん第一に考えている。手術は二部屋（手術機器2セット完備）で対応できるようになっており、本年度より最新のアルコン社製のコンステレーションを導入し、更なる手術時間の短縮が可能となり、時間内に多くの手術を行うことができる。白内障手術は多焦点眼内レンズの先進医療認定施設であり、乱視用眼内レンズの導入など患者様のニーズに合わせた治療を行っています。
当院は、網膜硝子体疾患に対応できる施設でもある。また、当院は脳神経疾患の患者さんが多いため、神経眼科疾患（視神経炎、複視など）が多く、大学病院並みの豊富な症例内科的疾患が多いのも特徴である。眼科腫瘍に対しては、他科との連携により、PETと最新の陽子線治療が可能である。水曜日、金曜日は、全科の症例検討会があり、他科との連携強化と、最新医療の習得ができます。24時間救急体制のため、眼科救急疾患も学べる。
加齢性黄斑変性症に対してはハイテルベルク社製のHRA＋OCTを導入し、診断の向上に努め、ルセンティス硝子体注射、PDT（光線力学療法）を行っている。また、レーザーは最新のニテク社製のレーザーと導入し、糖尿病網膜症などに対し、照射回数が少なく疼痛が軽減され患者さんの負担の軽減を図っている。最近では、国内・海外の学会発表にも力を入れている。当院は全身管理も含め、幅広い初期、中期、後期研修医の養成に努めている。